La Asamblea General es el órgano soberano de la Federación, integrada por todas las organizaciones que forman parte de Red Acoge y a quienes les corresponde un voto. La Asamblea representa la voluntad soberana de la Federación, aprueba las cuentas y obliga con sus acuerdos, válidamente adoptados, a la totalidad de sus entidades Federadas. Este órgano elige cada cuatro años al órgano ejecutivo, la Junta Directiva, que está integrada por ocho miembros que ocupan los cargos de presidencia, vicepresidencia, secretaría, tesorería y cuatro vocalías.

La composición de Red Acoge es el reflejo de la diversidad y pluralidad de las entidades de nuestra federación que se unen para trabajar en red por un mismo objetivo común: la mejora de las condiciones de vida de las personas migrantes y refugiadas y la defensa de sus derechos en todos los ámbitos de la vida. El consenso en la pluralidad es una de nuestras fortalezas.